1803 m. Vengerinės dvaro savininkas Juozapas Daumantas Sesickis atgabeno į kaimą koplyčią, ją išdidino ir pastatė pirmąją medinę Žiobiškio bažnyčią. Ji buvusi nedidelė, tad laikui bėgant imta galvoti apie tokią, į kurią tilptų visi parapijiečiai.
1902 m., atvykus energingam ir sumaniam klebonui kun. Vincentui Zapkui, šventovė pradėta statyti. Pirminiame inžinierių Prano Kontrimo ir Adolfo Oginskio bažnyčios projekte buvo numatyta pastatyti daugybę bokštelių, tačiau planas buvo pakoreguotas taip, kad prireiktų kuo mažiau išlaidų.
Galiausiai 1911 m. mūrinė Žiobiškio bažnyčia buvo baigta. Pastatyta iš skaldytų lauko akmenų ir degtų plytų su gražiai išryškintais langų apvadais, kontraforsais ir karnizais. Šventovė neogotikinio stiliaus, lotyniško kryžiaus plano, su aukštu 54 metrų bokštu fasade ir 4 mažais bokšteliais.