VI a. pab. – XVII a. pr. Panemunio dvaras išsidėstęs kairiajame Nemunėlio krante. 1598 m. Panemunis atiteko kunigaikščiui Jurgiui Masalskiui ir jo žmonai Onai Masalskienei, kuri, 1605 m. likusi našle, ištekėjo už Videniškių kunigaikščio Martyno- Marcelijaus Giedraičio. 1635 m. Giedraičiai dvarą pardavė Oziemblovskiams, kurie dvaro sodybą įkūrė dešiniajame Nemunėlio krante. 1773 m. dvaras atiteko Marikoniams. 1840 m. savininkais tapo Komarai. Juozas Komaras (?-1898) 1850 m. pastatė (ar perstatė?) rūmus. Mirus J. Komarui dvaras liko našlės bei dukterų Sofijos Komaraitės Gurskienės ir Elžbietos Komaraitės Krasickienės nuosavybe. Elžbieta Komaraitė Krasickienė su savo vyru Vitoldu Krasicku dvare išgyveno iki 1924 m. Po to dvarą nusipirko Osvaldas Laučiškis. Po 1945 m. rūmuose įkurta mokykla. 1993 m. dvaro pastatai grąžinti Osvaldo Laučiškio palikuonims.
Dvaro šeimininkai dėkoja už supratingumą ir pagarbą privatumui.